TS.BS. Phạm Hùng Vân có 35 năm giảng dạy về vi sinh y khoa tại ĐHYD TPHCM sau khi tốt nghiệp tại đây. Ông là người tiên phong trong việc gắn kết giữa đào tạo và nghiên cứu khoa học nhất là trong lãnh vực ông đảm trách.

Nhiều công trình nghiên cứu mới mẽ cũng được ông triển khai tại Trường Đại học Y Dược cũng như hỗ trợ nhiều trung tâm nghiên cứu khác trong nước.

Ông đã từng tu nghiệp tại Hà Lan, Hoa Kỳ, Hàn Quốc và cũng cùng với các nhà nghiên cứu của các tổ chức nước sở tại hợp tác các nghiên cứu về Sinh Học Phân Tử, Miễn Dịch Học lâm sàng và đề kháng các thuốc kháng sinh.